(一)自然保护区的性质及经营方向
太白山自然保护区的保护对象是：(1)具有典型性的暖温带地自然生态系统及其自然原始本底；(2)我国特产和国际特有的生物种与单种属、单种科及古老孑遗植物；(3)多样性的天然基因库；(4)完整的第四纪冰川遗迹；(5)重要的水源涵养地。总之，太白山自然保护区是一个以森林生态系统为主体的综合性自然保护区。

据此，太白山自然保护区的经营方向是：在切实保护好自然生态系统、跓竃诺困、各类生物种群生存、繁衍所需的特定生态环境的同时，开展科学研究，拯救濒危物种，发展珍稀野生动植物资源；探索自然资源的发展、消退的演替规律和合理利用自然资源的途径，发展以种植和养殖业为主的多种经营，给科研单位、大专院校提供科学研究和教学实习场所。为我国社会主义精神文明和物质文明建设服务。

(二)境界范围的调整
境界范围确定的正确与否，关系自然保护区的典型性、自然生态系统的完整性、保护物种的完备性和保护区的安全性。因之是关系自然保护区价值的重大问题。

太白山自然保护区，原是在陕西省林业调查设计院1960年进行秦岭中部III级森林经理调查时，所区划的防护林经营区的基础上划定的，总面积63557公顷，北坡最低点为海拔1400米的中山寺。1976年全省森林资源清查时，又将保护区东南部的大蟒河、老君岭等地段从保护区划出。面积减少到54103公颂。由于原先确定的境界范围，侧重森林经理，在自然景观的完整性和物种完备性方面都存在不足之处，加之森林资源清查时境界变动，使保护区的价值有所消弱。因之在此次考察中本着必须保证和满足完整的自然景观、珍稀动物的生活繁衍环境、珍稀植物的分布和生境以及保护对象的安全与便于保护，并适当考虑当地群众生产、生活的需要等原则，对原有境界范围进行了适当的调整。

(1)为保持垂直自然景观带谱的完整性，将北坡东段境界由海拔1400米的中山寺，降低到海拔780米的响水石。这样便在地貌景观上包进了低山丘陵，在植被景观上包进了栓皮栎林基带，完备了气候带。调入面积1284.1公顷，其中国有林(营头林场)750.8公顷，集体林533.3公顷。

(2)为保护核心区的安全，用红河内保护区的部分地段与营头林场讲行兑换，调出部分为红河上源的大赖沟，面积1031.2公顷；调入部分为大岔至斗母宫梁之间的地段(营头林场所有)，面积1269公顷。

(3)为保护珍稀物种，在保护区东南部的万泉沟，把原境界由海拔2300米降至1580米，调入部分原为厚畛子林场所有，面积271.9公顷。区内有小片的青杄林、铁杉林、羽叶丁香和华山松小蠹虫的寄生蜂稀有种。

(4)为保护特殊地貌类型和太白红杉的集中分布区，将鳌山白起庙梁以西的高山沼泽和白起庙梁至娘娘池之间的太白红杉林分布地段由省太白林业局调入保护区范围，面积906.2公顷。

通过调整使保护区面积由原来的54103公顷增至56803公顷，实增加面积2700公顷，周界由141公里增至162.5公里，增加21.5公里，使自然景观较前完整，保护物种有所增加，以森林为主体的山地生态系统相对完善。

(三)保护区的经营管理区划
经营管理区划，是自然保护区地域内部的组织问题，是按保护对象的价值等级及社会经济情况确定保护类别，具体的解决保护什么和怎样保护的工作。
1、区划原则：在“全面保护自然环境，积极开展科学研究，大力发展生物资源，为国家和人民造福”的指导思想下，区划的原则是：

(1)保证自然综合体的生态系统完整，使任何自然保护成分，必须保持其环境的一定特点和生存的充分条件。

(2)既要注意自然资源的保护和延续，又要注意自然资源的利用和发展，既发挥生态效益又发挥经济效益和社会效益。发展科学，创造财富。

(3)对典型的生物群落、森林类型和稀有种、残余种、特有种、分布边缘种及其群落(群聚)应加意保护。

(4)合理处理群众利益与自然保护的矛盾问题。

2、保护等级系统，根据太白山自然综合体中保护对象的价值等级分为：